碳盤查是以政府、企業等為單位計算其在社會和生產活動中各環節直接或者間接排放的溫室氣體，也可稱作編制溫室氣體排放清單。二者的區別如下：
1、受眾群體不同：
碳盤查面向所有存在溫室氣體排放的公司企業群體;
碳核查(在碳市場中)面向國家納入要求控排和碳交易需履約的企業群體(即2013至2014年中任意一年綜合能源消費總量達到1萬噸標準煤以上(含)的企業法人單位)。
2、工作主體不同：
碳盤查重在自查，企業可以內部組織或聘請相關咨詢機構對生產活動中產生的溫室氣體排放進行盤查。企業有權決定如何開展碳盤查的相關工作，遵循企業的相關方針制定和行動策劃，是一種自愿性質的內審行為。打個比方，好比做會計，企業自己做一個賬本。
碳核查重在配合，是由具備公信力的第三方機構對企業某一時間段的溫室氣體排放進行核查，碳核查該第三方核查機構必須獲得主管機構備案與辦法的核查資質，通常每年由發改委公開招標決定。企業無權決定核查過程，只能積極配合相關工作，是一種強迫性質的外審行為。打個比方，好比企業做的賬本的審計過程，叫做核查。
3、工作目的不同：
企業進行碳盤查基于自身生產和發展的考慮，主要目的是通過碳排放信息的披露吸引投資者與消費者的關注，提高社會責任與企業形象，達到國家政策要求，挖掘節能減排潛力;尤其對于出口型企業，越來越多的國外企業要求供應商做碳信息披露，甚至于產品碳足跡。
每年的碳核查工作是國家碳市場穩定運行的數據來源保證，通過歷史核查，為主管機構進行配額分配提供有力保障，通過年度核查確保納入企業碳排放數據真實有效，保障交易及履約的客觀公正，幫助國家掌握大數據情況，為全國碳市場的建設提供數據和決策支撐，為實現國家碳減排目標打好基礎。
4、常用標準不同：
碳盤查的主要標準規范包括國際標準化組織制定的ISO-14064-1、世界資源研究所與世界可持續發展工商理事會制定的溫室氣體議定書(GHG Protocol)。
碳核查(國內碳市場)的標準規范是由國家發改委制定的行業企業溫室氣體排放核查通用規范的ISO-14064-3。
5、工作要求不同：
碳盤查對于企業來說是一種主動行為，對排放基準、盤查周期、嚴格程度沒有強制性要求。企業可以在任何時間委托咨詢機構活自己組織發起對碳排放情況進行核算，提出整改意見。
碳核查是企業的被動行為，具有強制性。對納入國家碳市場的企業而言，每年都必須接受第三方機構對上一年度碳排放的核查，遵循相對嚴格的過程，以保證排放數據的準確性。
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